Disciplinas - PPGEE

Período de matrícula nas disciplinas que serão oferecidas em cada semestre de 2013.

1) 1º semestre 2013:
De: 25 de fevereiro a 08 de março de 2013

2) 2º semestre 2013:
De: 29 de julho a 09 de agosto de 2013.


Disciplinas oferecidas no primeiro semestre de 2013


Disciplinas oferecidas no segundo semestre de 2013


Disciplinas Obrigatórias:



Esta disciplina obrigatória será dividida em 2 módulos que irão abordar assuntos integrados das duas linhas de pesquisa do programa.

O módulo I abordará:

(1) A descrição dos padrões e processos evolutivos envolvidos na origem e manutenção da biodiversidade com um histórico da síntese moderna e a teoria neutra da evolução molecular e seu impacto na biologia evolutiva;
(2) Variabilidade genética e mecanismos evolutivos. Conceitos de espécie e mecanismos de especiação;
(3) Aplicações de filogenias em ecologia, classificação da biodiversidade e biologia evolutiva;
(4) A geografia da evolução.

O módulo II abordará:

(5) Os aspectos de ecofisiologia e interações fisiológicas entre os indivíduos e o ambiente;
(6) Interações populacionais;
(7) Estrutura e dinâmica de populações e comunidades;
(8) Diversidade biológica: conceitos, medidas, estimativas e padrões globais de distribuição;
(9) Princípios de ecologia de ecossistemas e paisagens.



Nesta disciplina o aluno de pós-graduação deverá integrar conhecimentos teóricos e práticos sobre o método científico e suas aplicações na área de "Ecologia e Evolução", com especial ênfase sobre os aspectos relacionados com o pensamento racional e a ciência; a formulação de perguntas, hipóteses e previsões; o planejamento de projetos; a captação de verbas; a execução de projetos; a redação de artigos e resumos científicos; a elaboração de apresentações orais; e cientometria.



Disciplinas Eletivas:



Distribuição de probabilidades; variáveis randômicas contínuas e discretas; planejamento de experimentos ecológicos; teorias e hipóteses; análise exploratória e variabilidade de dados ecológicos; regressão e correlação; análise de variância (ANOVA); two-way e multi-way ANOVA; fatores fixos e randômicos em ANOVA; análise de covariância; análise de medidas repetidas; análise de dados categóricos; regressão múltipla.



Introdução aos diferentes marcadores moleculares usados na caracterização da diversidade biológica em seus diferentes níveis hierárquicos e sua aplicação no entendimento de padrões e processos evolutivos e ecológicos e em questões relacionadas à conservação da biodiversidade. Análise genética de populações (quantificação da diversidade genética, métodos para inferência de fluxo gênico e estruturação populacional). Marcadores moleculares na Filogeografia. Identificação molecular de espécies, indivíduos e sexo para a resolução de incertezas taxonômicas, delimitação de espécies e de unidades de manejo, estudo de hibridização e análise forense. Genética molecular e conservação: conseqüências da redução no tamanho das populações e de sua fragmentação e estudo de espécies ameaçadas de extinção.



Introdução e História da Biografia; História da Terra; Distribuição geográfica; Dispersão e Migração; Especiação e Extinção; Biogeografia de Ilhas; Endemismo e Regionalização; Prática: PAE, VNDm e Elementos Bióticos; Princípios de Sistemática; Biogeografia Histórica; Prática: CADE, BPA, DIVA; Filogeografia; Relógio Molecular; Paleontologia; Geologia e Cenocrons; Cenários Geobióticos; Teste de Hipóteses em Biogeografia e Modelagem de Distribuição Geográfica; Prática SDM; Biogeografia da Conservação; Diversidade Filogenética



Esta disciplina se propõe a estudar os efeitos de ações, alterações e impactos provenientes de atividades antrópicas sob a diversidade biológica, através da apresentação e discussão de conhecimentos teóricos e exemplos práticos.

Parte I: Introdução à Biologia da Conservação; Biodiversidade; Degradação de habitat; Ameaças a Biodiversidade; Fragmentação de Paisagens; Biomas;

Parte II: Estudos de caso: I. Mata Atlântica; II. Cerrado Brasileiro; III: Agricultura e Florestas Comerciais (Certificação Florestal); IV: Espécies Invasoras; V: Restauração e Conservação dos Ecossistemas Tropicais.

Parte III: Elaboração de Planos de Conservação.



Modelos bem sucedidos em biologia de populações; crescimento populacional e dinâmica dependente e independente da densidade; teoria e dados em ecologia; dinâmica predador-presa e hospedeiro-parasitóide; análise de flutuações populacionais: estudo de casos; conseqüências evolutivas das interações populacionais; evolução da história de vida; metapopulações; estrutura espacial, migração, colonização e variabilidade genética das populações; fluxo gênico; polimorfismo em populações; seleção sexual; espécies exóticas e ecologia evolutiva.



Essa disciplina tem como objetivo o estudo da biodiversidade de parasitos encontrados infectando vertebrados aquáticos, buscando entender aspectos dos ciclos de vida, coevolução, distribuição, impactos do parasito sobre as populações dos hospedeiros e a interação parasito-hospedeiroambiente, tanto em ambiente natural como em sistemas de criação.



Processos adaptativos e evolução de caracteres fisiológicos; princípios fisiológicos aplicados ao estudo da ecofisiologia; taxa metabólica e relações com a massa corpórea; orçamento energético e métodos de estudo em fisiologia metabólica; ambientes extremos e relações com a capacidade metabólica; mudanças sazonais e sua influência sobre o balanço energético; efeitos das mudanças ambientais provocadas pelo homem sobre o desempenho fisiológico de animais.



Treinamento intensivo de campo visando consolidar o processo de formulação de hipóteses científicas, delineamento amostral, coleta e processamento de informações e análise de dados em Ecologia. Aprimoramento das técnicas de comunicação científica, escrita e oral.



Parte I: Histórico, vertentes, definições, princípios e a perspectiva ecológica da paisagem:

Parte II: Padrão e Estrutura da Paisagem: causas e processos, origens e mudanças, conceito de escala, terminologias e quantificação de padrões espaciais;

Parte III: Dinâmica da Paisagem: marcadores espaciais e temporais; processos ecológicos na escala da paisagem, modificações e evolução da paisagem (ritmos naturais e antrópicos), fragmentação de habitats e suas consequências.

Parte IV: Principais técnicas e ferramentas de análise da paisagem: índices de paisagem, "Fragstats" e "Patch analyst".

Parte V: Conservação de paisagens, com ênfase em temas e técnicas de recuperação de paisagens fragmentadas ou degradadas por ação antrópica.



Conceitos fundamentais em Ecologia de Comunidades. Padrões de distribuição de riqueza de espécies. Modelos de distribuição de abundância. Índices de diversidade. Índices de similaridade aplicados a comunidades. Análise Hierárquica de Cluster (AHC) aplicada à comparação entre comunidades. Introdução à utilização de softwares para análise de estrutura de comunidades.



A Etnobotânica e a Etnofarmacologia procuram resgatar e entender como se dá o uso que certas culturas fazem ou fizeram dos recursos naturais disponíveis em seu meio ambiente. A primeira foca a relação homem-planta nas suas múltiplas finalidades: alimentares, cosméticas, corantes, medicinais, tóxicas, para caça e pesca, ornamentais, fibras, fertilizantes, óleos, para a construção civil e naval. Enquanto a segunda destina-se ao entendimento da relação homem-recursos naturais (animais, vegetais, minerais e fungos), com finalidades medicinais e/ou tóxicas. Ambas fornecem subsídios para aplicações nas áreas de Tecnologia, Saúde e Ecologia.



Introdução à filogeografia. Revisão dos processos evolutivos: seu contexto espacial e temporal. Análises de diferenciação populacional. Índices de fixação, Análise de Variância Molecular. Tamanho populacional efetivo. Análise estatística Bayesiana de estrutura populacional. Testes de alocação de indivíduos (“Assignment tests”). Teoria da coalescência. Estimativas coalescentes de tamanho efetivo populacional. Estimativas coalescentes de migração/fluxo gênico. Estimativas coalescentes de tempo de divergência. Análise de Clados Agrupados (“Nested Clade Analysis”) versus Computação Bayesiana Aproximada. Filogeografia Estatística e testes de hipóteses. Implicações de estudos em filogeografia: evolução e organização da diversidade biológica; distinção de escalas espacio-temporais; conservação da biodiversidade.



Histórico. Homologia, analogia, convergência e paralelismo. Plesiomorfias, apomorfias, simplesiomorfias, sinapomorfias, homoplasias. Dendrogramas e cladogramas. Grupos monofiléticos, parafiléticos e polifiléticos. Formulação de hipóteses e delineamento de projetos em filogenia. Preparação da matriz de dados. Caracteres morfológicos: descrição e codificação. Caracteres fenotípicos alternativos. Sequências de DNA: amostragem, escolha das regiões, alinhamento, qualidade dos dados. Marcadores moleculares alternativos para reconstrução de filogenias. Pesagem. Grupo externo e polarização de caracteres. Árvores enraizadas e não-enraizadas. Modelos de substituição. Métodos de distância. Critérios de otimização: vantagens e limitações. Máxima parcimônia . Máxima verossimilhança e seleção de modelos. Inferência bayesiana. Descritores dos resultados. Medidas de suporte. Métodos de consenso e congruência. Árvores de genes x árvores de espécies. Polimorfismo ancestral. Superárvores. Recursos computacionais (softwares).Interpretação e utilização de cladogramas: classificação, evolução de caracteres, estudos em biologia comparada, conservação, co-evolução, biogeografia.